Noviherbaspirillum malthae
Cet article est une ébauche concernant la bactériologie.
Vous pouvez partager vos connaissances en l’améliorant (comment ?) selon les recommandations des projets correspondants.
| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Phylum | Pseudomonadota |
| Classe | Betaproteobacteria |
| Ordre | Burkholderiales |
| Famille | Oxalobacteraceae |
| Genre | Noviherbaspirillum |
Noviherbaspirillum malthae est une espèce de bactéries gram-négatives de la famille des Oxalobacteraceae.
Historique[modifier | modifier le code]
L'espèce Noviherbaspirillum malthae a été décrite en 2013 sur la base d'une souche de bactérie isolée d'un sol contaminé par du pétrole dans la ville de Kaohsiung à Taïwan[1].
Description[modifier | modifier le code]
L'espèce Noviherbaspirillum malthae est formée de bactéries gram-négatives aérobies en forme de bacilles avec des flagelles polaires. Les bacilles sont longs de 1,4 à 1,6 µm et larges de 1,0 à 1,2 µm[2]. Les colonies de N. malthae sont de couleur paille, circulaires et lisses lorsque cette bactérie est cultivée sur milieu NA. La souche type de l'espèce, CC-AFH3, n'est pas fluorescente et ne produit pas d'acide à partir de différents carbohydrates[3]. La croissance de ces bactéries est optimale à 30 °C et à un pH de 6.0 mais elle est possible aussi sur une gamme de 20 à 40 °C et à des pH de 5.0 à 10.0[2]. Ces bactéries peuvent croître s'il y a moins de 2 % de NaCl[2].
Noviherbaspirillum malthae peut se contenter comme unique source de carbone l'acide β-hydroxybutirique, la L-proline et le Tween 80. Pour cela, elle ne peut pas utiliser le 2,3-butanediol'acide acétique, l'acide D-glucuronique, l'acide lactique, le D-fructose, l'α-D-glucose, glycérol, Glycogène, et le méthyl ester d'acide pyruvique[4]. Ces bactéries ne sont pas capables de réduire le nitrate et le nitrite[4]. Au niveau des caractères biochimiques, elles présentent des réactions positives pour les tests de la phosphatase alcaline, de la phosphatase acide, de l'estérase (C4), de la lipase estérase, de la lipase, de la leucine arylamidase, la valine arylamidase, la cystine arylamidase et la naphthol-AS-BI-phosphohydrolase[4]. Cette espèce a des réactions négatives pour les tests trypsine, α-chymotrypsine, α-galactosidase, β-galactosidase, β-glucuronidase, α-glucosidase, β-glucosidase, N-acetyl-β-glucosaminidase, α-mannosidase et α- fucosidase[5].
Le contenu en bases nucléiques G+C est de 63,4 %[5].
Taxonomie[modifier | modifier le code]
Le nom correct complet (avec auteur) de ce taxon est Noviherbaspirillum malthae Lin et al. 2013[6]. La souche type de cette espèce est la souche CC-AFH3 déposée dans des banques de cultures bactériennes sous les identifiants BCRC 80516 et JCM 18414[6],[1].
Étymologie[modifier | modifier le code]
L'étymologie du nom de cette espèce est la suivante : mal.tha’e. L. fem. n. maltha, une sorte de pétrole épais; L. gen. fem. n. malthae, du pétrole, car la souche type a été isolée d'un site contaminé par du pétrole[6].
Phylogénie[modifier | modifier le code]
Les analyses phylogénétiques basées sur la séquence de l'ARN ribosomale 16S ont montré que la séquence de l'espèce Noviherbaspirillum malthae est très homologue avec les souches types des espèces Herbaspirillum soli (96,5 %), H. aurantiacum (96,3 %), H. canariense (96 %), et H. psychrotolerans (95,4 %). Dans le même temps, les autres espèces d'Herbaspirillum sont homologues à moins de 95,4 % et forment un clade différent[7]. Lors de la description de l'espèce Noviherbaspirillum humi, les analyses phylogénétiques montrent que l'espèce N. malthae est la plus proche[8].
Références[modifier | modifier le code]
- Lin et et al. 2013, p. 4105.
- Lin et et al. 2013, p. 4103.
- Lin et et al. 2013, p. 4101.
- Lin et et al. 2013, p. 4104.
- Lin et et al. 2013, p. 4104-4105.
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 9 avril 2024
- Lin et et al. 2013, p. 4102.
- (en) Aravind Sundararaman, Sathiyaraj Srinivasan et Sang-Seob Lee, « Noviherbaspirillum humi sp. nov., isolated from soil. », Antonie Van Leeuwenhoek, vol. 109, no 3, , p. 697-704 (DOI 10.1007/s10482-016-0670-0)
Bibliographie[modifier | modifier le code]
- Publication originale (en) Shih-Yao Lin, Asif Hameed, A.B. Arun, You-Cheng Liu, Yi-Han Hsu, Wei-An Lai, P.D. Rekha et Chiu-Chung Young, « Description of Noviherbaspirillum malthae gen. nov., sp. nov., isolated from an oil-contaminated soil, and proposal to reclassify Herbaspirillum soli, Herbaspirillum aurantiacum, Herbaspirillum canariense and Herbaspirillum psychrotolerans as Noviherbaspirillum soli comb. nov., Noviherbaspirillum aurantiacum comb. nov., Noviherbaspirillum canariense comb. nov. and Noviherbaspirillum psychrotolerans comb. nov. based on polyphasic analysis. », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 63, no 11, , p. 4100-4107 (DOI 10.1099/ijs.0.048231-0).
Liens externes[modifier | modifier le code]
- (fr + en) Référence EOL : Noviherbaspirillum malthae (consulté le )
- (fr + en) Référence GBIF : Noviherbaspirillum malthae Lin et al., 2013 (consulté le )
- (en) Référence LPSN : Noviherbaspirillum malthae Lin et al. 2013 (consulté le )
- (en) Référence NCBI : Noviherbaspirillum malthae (taxons inclus) (consulté le )
- (en) Référence Taxonomicon : Noviherbaspirillum malthae Lin et al. 2013 (consulté le )
